CGDB Gene Information
Tag | Content | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CGDB ID | CGD-MuM-021066 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | O54943; O54943; PER2_MOUSE; O54954 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Period circadian protein homolog 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Per2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_035196.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_011066.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL (Genbank) ID | AAC39942.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Mus musculus (Mouse) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 10090 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Circadian Information |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Transcriptional repressor which forms a core component of the circadian clock. The circadian clock, an internal time-keeping system, regulates various physiological processes through the generation of approximately 24 hour circadian rhythms in gene expression, which are translated into rhythms in metabolism and behavior. It is derived from the Latin roots ''circa'' (about) and ''diem'' (day) and acts as an important regulator of a wide array of physiological functions including metabolism, sleep, body temperature, blood pressure, endocrine, immune, cardiovascular, and renal function. Consists of two major components: the central clock, residing in the suprachiasmatic nucleus (SCN) of the brain, and the peripheral clocks that are present in nearly every tissue and organ system. Both the central and peripheral clocks can be reset by environmental cues, also known as Zeitgebers (German for ''timegivers''). The predominant Zeitgeber for the central clock is light, which is sensed by retina(View all) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM Sites Count: 56 (View all) |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) |
MNGYVDFSPS PTSPTKEPGA PQPTQAVLQE DVDMSSGSSG NENCSTGRDS QGSDCDDNGK 60 ELRMLVESSN THPSPDDAFR LMMTEAEHNP STSGCSSEQS AKADAHKELI RTLKELKVHL 120 PADKKAKGKA STLATLKYAL RSVKQVKANE EYYQLLMSSE SQPCSVDVPS YSMEQVEGIT 180 SEYIVKNADM FAVAVSLVSG KILYISNQVA SIFHCKKDAF SDAKFVEFLA PHDVSVFHSY 240 TTPYKLPPWS VCSGLDSFTQ ECMEEKSFFC RVSVGKHHEN EIRYQPFRMT PYLVKVQEQQ 300 GAESQLCCLL LAERVHSGYE APRIPPEKRI FTTTHTPNCL FQAVDERAVP LLGYLPQDLI 360 ETPVLVQLHP SDRPLMLAIH KKILQAGGQP FDYSPIRFRT RNGEYITLDT SWSSFINPWS 420 RKISFIIGRH KVRVGPLNED VFAAPPCPEE KTPHPSVQEL TEQIHRLLMQ PVPHSGSSGY 480 GSLGSNGSHE HLMSQTSSSD SNGQEESHRR RSGIFKTSGK IQTKSHVSHE SGGQKEASVA 540 EMQSSPPAQV KAVTTIERDS SGASLPKASF PEELAYKNQP PCSYQQISCL DSVIRYLESC 600 SEAATLKRKC EFPANIPSRK ATVSPGLHSG EAARPSKVTS HTEVSAHLSS LTLPGKAESV 660 VSLTSQCSYS STIVHVGDKK PQPELETVED MASGPESLDG AAGGLSQEKG PLQKLGLTKE 720 VLAAHTQKEE QGFLQRFREV SRLSALQAHC QNYLQERSRA QASDRGLRNT SGLESSWKKT 780 GKNRKLKSKR VKTRDSSEST GSGGPVSHRP PLMGLNATAW SPSDTSQSSC PSAPFPTAVP 840 AYPLPVFQAP GIVSTPGTVV APPAATHTGF TMPVVPMGTQ PEFAVQPLPF AAPLAPVMAF 900 MLPSYPFPPA TPNLPQAFLP SQPHFPAHPT LASEITPASQ AEFPSRTSTL RQPCACPVTP 960 PAGTVALGRA SPPLFQSRGS SPLQLNLLQL EEAPEGSTGA AGTLGTTGTA ASGLDCTSGT 1020 SRDRQPKAPP TCNEPSDTQN SDAISTSSDL LNLLLGEDLC SATGSALSRS GASATSDSLG 1080 SSSLGFGTSQ SGAGSSDTSH TSKYFGSIDS SENNHKAKMI PDTEESEQFI KYVLQDPIWL 1140 LMANTDDSIM MTYQLPSRDL QAVLKEDQEK LKLLQRSQPR FTEGQRRELR EVHPWVHTGG 1200 LPTAIDVTGC VYCESEEKGN ICLPYEEDSP SPGLCDTSEA KEEEGEQLTG PRIEAQT 1257 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nucleotide Sequence (Fasta) |
ATGAATGGAT ACGTGGACTT CTCCCCAAGT CCCACCAGTC CCACCAAGGA GCCAGGGGCA 60 CCTCAGCCCA CCCAGGCTGT GCTCCAGGAA GACGTGGACA TGAGCAGTGG CTCCAGCGGA 120 AACGAGAACT GCTCCACGGG ACGGGACTCT CAGGGCAGTG ACTGCGACGA CAATGGGAAG 180 GAGCTGCGGA TGCTCGTGGA ATCTTCCAAC ACTCACCCCA GCCCTGATGA TGCCTTCAGA 240 CTCATGATGA CAGAGGCAGA GCACAACCCC TCCACGAGCG GCTGCAGTAG TGAGCAGTCT 300 GCCAAAGCTG ACGCACACAA AGAACTGATA AGGACCCTGA AGGAGCTGAA GGTCCACCTC 360 CCTGCAGACA AGAAGGCCAA GGGGAAGGCC AGCACGCTGG CAACCCTGAA GTATGCCCTG 420 CGGAGCGTGA AGCAGGTGAA GGCTAATGAG GAGTACTACC AGCTGCTAAT GTCCAGTGAG 480 AGCCAGCCCT GCAGTGTGGA TGTGCCTTCC TACAGCATGG AGCAGGTTGA GGGCATTACC 540 TCCGAGTATA TCGTGAAGAA CGCGGATATG TTTGCTGTGG CTGTGTCCCT GGTTTCTGGG 600 AAGATCCTGT ACATCTCTAA CCAAGTGGCC TCCATCTTTC ACTGTAAGAA GGACGCCTTC 660 AGTGATGCCA AGTTTGTGGA GTTCCTGGCT CCTCATGACG TCAGTGTGTT CCACAGCTAC 720 ACCACCCCTT ACAAGCTTCC GCCCTGGAGT GTGTGCAGCG GCTTAGATTC TTTCACTCAG 780 GAGTGCATGG AGGAGAAATC TTTTTTCTGC CGTGTCAGTG TTGGGAAACA CCACGAGAAT 840 GAGATTCGCT ACCAGCCCTT CCGCATGACA CCCTACCTGG TCAAGGTGCA AGAGCAGCAG 900 GGTGCTGAGA GCCAGCTCTG CTGCCTGCTG CTGGCAGAGA GGGTACACTC GGGCTATGAA 960 GCGCCTAGAA TCCCTCCTGA GAAGAGGATC TTCACAACAA CCCACACACC AAACTGCTTG 1020 TTCCAGGCTG TGGATGAAAG GGCGGTCCCC CTCCTGGGCT ATCTACCTCA GGATCTGATC 1080 GAGACGCCTG TGCTCGTGCA GCTCCACCCC AGCGACCGGC CCTTGATGCT CGCCATCCAC 1140 AAGAAGATCC TACAGGCCGG TGGACAGCCT TTCGATTATT CTCCCATTCG ATTCCGCACC 1200 CGCAACGGGG AGTACATCAC ACTGGACACT AGCTGGTCCA GCTTCATCAA CCCGTGGAGC 1260 AGGAAGATAT CTTTCATCAT TGGGAGGCAC AAAGTCAGGG TAGGCCCTTT GAATGAGGAT 1320 GTGTTCGCAG CTCCCCCGTG CCCAGAGGAG AAGACTCCGC ACCCCAGCGT TCAGGAGCTC 1380 ACAGAACAAA TCCACCGGCT ACTGATGCAG CCTGTCCCCC ACAGCGGCTC CAGTGGCTAT 1440 GGGAGCCTGG GCAGTAACGG ATCCCACGAA CACCTCATGA GCCAGACATC ATCCAGCGAC 1500 AGCAATGGCC AAGAGGAGTC TCACCGGAGG AGATCCGGAA TTTTTAAAAC CAGTGGCAAG 1560 ATTCAAACCA AAAGTCACGT TTCTCATGAG TCTGGAGGAC AGAAGGAAGC ATCTGTTGCA 1620 GAAATGCAAA GCAGCCCCCC AGCTCAGGTG AAAGCTGTCA CCACCATAGA AAGGGACAGC 1680 TCAGGGGCCA GCCTACCCAA GGCCAGCTTC CCAGAGGAAC TAGCCTATAA GAACCAGCCT 1740 CCTTGCTCCT ACCAGCAGAT CAGCTGCCTG GACAGTGTCA TCAGGTACCT GGAGAGCTGC 1800 AGCGAGGCAG CCACCCTGAA AAGGAAGTGC GAGTTCCCAG CCAACATCCC ATCCCGGAAG 1860 GCCACAGTCA GCCCCGGGCT GCACTCTGGA GAGGCAGCGC GGCCCTCCAA GGTGACCAGC 1920 CACACAGAGG TCAGTGCTCA CCTGAGCTCC CTGACGCTGC CAGGCAAGGC CGAGAGTGTG 1980 GTGTCCCTCA CCAGCCAGTG CAGCTACAGC AGCACCATCG TGCATGTGGG CGACAAAAAG 2040 CCACAGCCCG AGCTAGAGAC GGTAGAAGAT ATGGCCAGTG GGCCCGAGTC CCTGGATGGT 2100 GCGGCCGGCG GCCTCAGCCA AGAAAAGGGG CCTCTTCAGA AGTTGGGCCT CACCAAGGAA 2160 GTTCTGGCTG CACATACACA GAAAGAGGAG CAGGGCTTCC TGCAGAGGTT CAGGGAGGTG 2220 AGCAGGCTCA GTGCCCTGCA GGCTCACTGC CAGAACTATC TCCAGGAGCG GTCCCGAGCC 2280 CAGGCGAGTG ATCGAGGACT AAGAAATACT TCTGGACTAG AGTCATCTTG GAAAAAAACT 2340 GGAAAGAACA GGAAACTGAA GTCAAAACGC GTCAAGACTC GGGACTCTTC TGAGAGCACA 2400 GGGTCTGGAG GACCAGTGTC CCACCGACCT CCCCTCATGG GCCTGAATGC CACAGCCTGG 2460 TCACCCTCCG ACACATCCCA GTCCAGCTGC CCCTCTGCAC CCTTCCCCAC CGCAGTGCCA 2520 GCTTACCCCC TACCTGTGTT CCAGGCACCC GGAATAGTAT CCACACCAGG GACGGTGGTG 2580 GCGCCACCTG CAGCCACCCA CACTGGCTTC ACCATGCCTG TTGTGCCTAT GGGCACCCAG 2640 CCTGAATTCG CAGTGCAGCC CCTGCCATTC GCTGCCCCTT TGGCTCCTGT CATGGCCTTC 2700 ATGCTGCCCA GCTACCCGTT CCCACCAGCA ACCCCAAACC TGCCTCAGGC CTTCCTCCCC 2760 AGCCAGCCTC ACTTTCCAGC CCACCCCACA CTTGCCTCCG AAATAACTCC TGCCTCCCAG 2820 GCTGAGTTCC CTAGTCGGAC CTCGACGCTC AGACAGCCGT GCGCTTGCCC AGTCACCCCT 2880 CCAGCCGGCA CAGTGGCCCT GGGCAGAGCC TCCCCACCGC TCTTCCAGTC CAGAGGCAGT 2940 AGTCCCCTAC AACTTAACCT GCTTCAGCTA GAGGAGGCGC CTGAAGGCAG CACTGGAGCC 3000 GCAGGGACCC TGGGGACCAC AGGGACAGCA GCTTCTGGTC TGGACTGCAC ATCTGGCACA 3060 TCTCGGGATC GGCAGCCAAA GGCACCTCCA ACATGCAACG AGCCCTCAGA CACTCAGAAC 3120 AGTGATGCCA TCTCCACGTC AAGTGACCTG CTCAACCTCC TTCTGGGCGA GGACCTCTGC 3180 TCGGCCACTG GCTCAGCCCT GTCTAGAAGC GGGGCATCCG CCACCTCAGA CTCTCTGGGC 3240 TCCAGCTCGC TGGGCTTCGG CACATCCCAA AGTGGGGCAG GCAGTAGTGA CACAAGTCAC 3300 ACCAGCAAAT ACTTTGGAAG CATTGACTCT TCAGAGAATA ATCACAAAGC AAAAATGATC 3360 CCAGACACGG AGGAAAGCGA GCAGTTCATT AAGTACGTCT TGCAGGACCC CATCTGGCTG 3420 CTGATGGCCA ACACAGACGA CAGCATCATG ATGACATACC AGCTGCCCTC CCGGGATCTC 3480 CAGGCGGTGT TGAAGGAGGA CCAGGAGAAG CTGAAGCTGC TGCAGAGGTC CCAGCCCCGG 3540 TTCACAGAGG GCCAGAGGCG AGAGCTCCGA GAGGTTCATC CGTGGGTCCA CACTGGGGGC 3600 CTGCCTACGG CCATCGATGT GACAGGCTGT GTTTACTGCG AGAGTGAGGA GAAAGGCAAC 3660 ATTTGCCTGC CATATGAGGA AGACAGTCCT TCCCCGGGAC TCTGTGATAC CTCAGAAGCC 3720 AAAGAGGAGG AAGGTGAACA GCTGACAGGC CCCAGGATAG AGGCCCAGAC GTAA 3774 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Source | Uniprot/ENA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0002--3D-structure |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005737--C:cytoplasm |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interpro | IPR000014--PAS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE | PS50112--PAS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | SM00091--PAS |