CGDB Gene Information
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CGDB ID | CGD-HoS-021431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | P56645; P56645; PER3_HUMAN; Q5H8X4; Q5H8X5; Q969K6; Q96S77; Q96S78; Q9C0J3; Q9NSP9; Q9UGU8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Period circadian protein homolog 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | PER3; GIG13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information | ENST000003619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_001276790.1; NP_001276791.1; NP_001276792.1; NP_001276793.1; NP_058515.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_001289861.1; NM_001289862.1; NM_001289863.1; NM_001289864.1; NM_016831.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL (Genbank) ID | BAB63250.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Homo sapiens (Human) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Circadian Information |
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Description | Originally described as a core component of the circadian clock. The circadian clock, an internal time-keeping system, regulates various physiological processes through the generation of approximately 24 hour circadian rhythms in gene expression, which are translated into rhythms in metabolism and behavior. It is derived from the Latin roots ''circa'' (about) and ''diem'' (day) and acts as an important regulator of a wide array of physiological functions including metabolism, sleep, body temperature, blood pressure, endocrine, immune, cardiovascular, and renal function. Consists of two major components: the central clock, residing in the suprachiasmatic nucleus (SCN) of the brain, and the peripheral clocks that are present in nearly every tissue and organ system. Both the central and peripheral clocks can be reset by environmental cues, also known as Zeitgebers (German for ''timegivers''). The predominant Zeitgeber for the central clock is light, which is sensed by retina and signals d(View all) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM Sites Count: 25 (View all) |
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Protein Sequence (Fasta) |
MPRGEAPGPG RRGAKDEALG EESGERWSPE FHLQRKLADS SHSEQQDRNR VSEELIMVVQ 60 EMKKYFPSER RNKPSTLDAL NYALRCVHSV QANSEFFQIL SQNGAPQADV SMYSLEELAT 120 IASEHTSKNT DTFVAVFSFL SGRLVHISEQ AALILNRKKD VLASSHFVDL LAPQDMRVFY 180 AHTARAQLPF WNNWTQRAAR YECAPVKPFF CRIRGGEDRK QEKCHSPFRI IPYLIHVHHP 240 AQPELESEPC CLTVVEKIHS GYEAPRIPVN KRIFTTTHTP GCVFLEVDEK AVPLLGYLPQ 300 DLIGTSILSY LHPEDRSLMV AIHQKVLKYA GHPPFEHSPI RFCTQNGDYI ILDSSWSSFV 360 NPWSRKISFI IGRHKVRTSP LNEDVFATKI KKMNDNDKDI TELQEQIYKL LLQPVHVSVS 420 SGYGSLGSSG SQEQLVSIAS SSEASGHRVE ETKAEQMTLQ QVYASVNKIK NLGQQLYIES 480 MTKSSFKPVT GTRTEPNGGG ECKTFTSFHQ TLKNNSVYTE PCEDLRNDEH SPSYQQINCI 540 DSVIRYLKSY NIPALKRKCI SCTNTTSSSS EEDKQNHKAD DVQALQAGLQ IPAIPKSEMP 600 TNGRSIDTGG GAPQILSTAM LSLGSGISQC GYSSTIVHVP PPETARDATL FCEPWTLNMQ 660 PAPLTSEEFK HVGLTAAVLS AHTQKEEQNY VDKFREKILS SPYSSYLQQE SRSKAKYSYF 720 QGDSTSKQTR SAGCRKGKHK RKKLPEPPDS SSSNTGSGPR RGAHQNAQPC CPSAASSPHT 780 SSPTFPPAAM VPSQAPYLVP AFPLPAATSP GREYAAPGTA PEGLHGLPLS EGLQPYPAFP 840 FPYLDTFMTV FLPDPPVCPL LSPSFLPCPF LGATASSAIS PSMSSAMSPT LDPPPSVTSQ 900 RREEEKWEAQ SEGHPFITSR SSSPLQLNLL QEEMPRPSES PDQMRRNTCP QTEYCVTGNN 960 GSESSPATTG ALSTGSPPRE NPSHPTASAL STGSPPMKNP SHPTASALST GSPPMKNPSH 1020 PTASTLSMGL PPSRTPSHPT ATVLSTGSPP SESPSRTGSA ASGSSDSSIY LTSSVYSSKI 1080 SQNGQQSQDV QKKETFPNVA EEPIWRMIRQ TPERILMTYQ VPERVKEVVL KEDLEKLESM 1140 RQQQPQFSHG QKEELAKVYN WIQSQTVTQE IDIQACVTCE NEDSADGAAT SCGQVLVEDS 1200 C 1201 |
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Nucleotide Sequence (Fasta) |
TGAACAGCAA GATCGAAACA GAGTTTCTGA AGAACTTATC ATGGTTGTCC AAGAAATGAA 60 AAAATATTTC CCCTCGGAGA GACGCAATAA ACCAAGCACT CTAGATGCCC TCAACTATGC 120 TCTCCGCTGT GTCCACAGCG TTCAAG 146 |
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Sequence Source | Uniprot/ENA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
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Keyword | KW-0025--Alternative splicing |
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Gene Ontology | GO:0005737--C:cytoplasm |
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Interpro | IPR000014--PAS |
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PROSITE | PS50112--PAS |
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Pfam | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | SM00091--PAS |