CGDB Gene Information
| Tag | Content | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CGDB ID | CGD-MeG-072597 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl Accession | ENSMGAP00000000394.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl Information | ENSMGAG00000000952.1 ; ENSMGAT00000001031.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Meleagris gallopavo | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NCBI Taxa ID | 9103 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Circadian Information |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:PER3 description:period circadian clock 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:8847](View all) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Sequence (Fasta) |
SDRLDWGQSH KDLMVMIQEI KKCLPEEKRS SSKPSTISAL NYALRCVQQV RANNEFFQAL 60 SDRRVFQMDV MTYSIEELVT VASEHTPKNN DTFVAVFSLL SGRILHISEQ AASILNHKKK 120 VLESSRFVEL LAPQDASVFY AHTDQSHLPL WYTESQTVAS LYDYAQVKSF FCRIRGGKDQ 180 EQEMHWYPFR ITPYLVHVCT SVHVDAESCC LALAEKIHSG YEAPRIPMDK RIFTTTHTPG 240 CVFLEIDDRA VPLLGYLPQD LIGTSILMYL HPEDRPLMIT IHRKILKFAG QPPFEYLPIR 300 FCTQNGDYVI LDTSWSSFVN PWSRKVAFII GRHRVRTSPL NEDVFATRGQ ETSSVEKEIK 360 ELQGQIYKLL LQPVHSNVSS GYGSLGSSGS YEHYISVASS SDSNGNCAEE TQEPVTLQQV 420 CADVNRIKNL GQQLYIASRS KPQNGNEQPM GSEVLEGKTL RSDSTEELGN ALYDDSKKTP 480 HVPSYQQINC VDSIIRYLES CSVPVLKRKS KSSTNTSSSS DGDKKNQEIG ALGVNSQTPV 540 FADQEEMLKK QTNEGIVGAP LPDLTLSNKS LSVGSASSQC SYSSTIVHVP HPESVPCFPL 600 RCNFTTYFSN APNPVTVAEE LKPVGLTKEA LSVHTQKEEQ NYVDRFRRRI LLSPFRTCLQ 660 WDSRSNNGHS YDQGNSPSKE MTPTSCKNGK KGKFKHWKPQ RQSSDRRSRS KNRNSFPCEK 720 RRIQKQSLSP SEMSCLRSSS TNCFPPVGFP VYSDALSSFQ ASSIGEELAI YSTKPEPTSL 780 SQLCCGAPSI PALSPPNMGM FMAAFFHNFP IYAQMPQYAF LPSPQNVYLP SSYPCTTLPP 840 APPPSAPSAI APVSVGQSYP AFSAASTEEQ PEGQHGWALQ LSSSRSSSPL QLNLLQEELP 900 ESAEPLVNAD VKVYAEAKCG TNNTGGRETT FEPMGTCSSA ELVLSKSHSA LAMLSLFFSP 960 LNCESHSLCG ELKQRKPPGD NSREDSGNSA SSHCASCECT DRLLREDSQS GAGSAASAGS 1020 RKSSKYFASN DSSETSKTDT NQEAKEKQTS HKSKHESAWV TMDRTPEQVL MTYQMPNRIK 1080 EEVLKEDMEK LIVMRQQQPW FSDRQKRELA EVHTWLQTQT VPLQINIQGC VTCDIREATC 1140 EAAMADDNM 1149 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide Sequence (Fasta) |
AGTGATCGGC TGGATTGGGG TCAGTCTCAC AAAGATCTGA TGGTGATGAT CCAAGAAATC 60 AAAAAGTGTT TGCCTGAAGA GAAAAGGAGT TCCAGCAAGC CCAGCACCAT CAGTGCTCTC 120 AATTATGCTT TACGGTGTGT ACAGCAGGTC CGAGCAAACA ATGAGTTTTT CCAGGCTCTC 180 AGTGATCGAA GAGTGTTCCA GATGGATGTG ATGACATACA GTATAGAAGA GTTGGTGACA 240 GTTGCATCAG AACACACTCC AAAAAACAAT GACACCTTTG TGGCTGTGTT CTCCCTGCTT 300 TCTGGGCGCA TACTGCATAT TTCTGAGCAA GCAGCATCCA TTCTAAACCA TAAGAAGAAA 360 GTCTTGGAAT CCTCTCGGTT TGTAGAGCTT CTTGCCCCTC AGGATGCAAG TGTGTTCTAT 420 GCACACACTG ATCAGTCTCA CTTGCCACTT TGGTACACGG AAAGTCAAAC AGTAGCCTCT 480 CTGTATGACT ATGCCCAGGT GAAATCCTTT TTCTGCAGGA TCAGAGGTGG TAAAGATCAA 540 GAACAAGAAA TGCACTGGTA TCCATTCCGA ATCACCCCAT ACTTGGTCCA TGTCTGCACC 600 TCTGTCCACG TGGATGCAGA GTCCTGTTGC TTAGCTTTGG CTGAGAAAAT TCACTCTGGA 660 TATGAAGCTC CTCGGATTCC TATGGATAAA AGAATCTTCA CCACTACTCA CACTCCGGGA 720 TGTGTTTTTC TTGAGATAGA TGACAGAGCA GTGCCTTTGT TGGGTTACCT ACCTCAGGAT 780 TTGATTGGAA CATCCATACT GATGTATTTG CATCCAGAAG ATCGTCCTTT AATGATCACT 840 ATTCACCGTA AAATCCTGAA ATTTGCTGGC CAGCCTCCTT TTGAATACTT ACCCATTAGG 900 TTTTGCACTC AAAATGGGGA TTATGTCATC CTGGATACCA GCTGGTCCAG TTTTGTGAAT 960 CCATGGAGCA GGAAAGTAGC ATTCATCATT GGCCGACACA GAGTCCGAAC AAGCCCTCTG 1020 AATGAAGATG TCTTTGCTAC AAGAGGTCAA GAAACTAGCA GTGTTGAGAA AGAGATAAAA 1080 GAATTGCAAG GACAAATTTA CAAGCTGCTT TTGCAGCCAG TTCATAGCAA CGTTTCCAGT 1140 GGTTATGGTA GCCTTGGTAG CAGTGGTTCT TATGAGCACT ACATCAGTGT AGCATCTTCA 1200 AGCGACTCCA ATGGAAATTG TGCAGAGGAA ACACAAGAAC CAGTGACTTT GCAGCAGGTG 1260 TGTGCAGATG TCAACCGGAT AAAGAATCTG GGACAGCAGC TGTATATTGC ATCAAGGAGC 1320 AAGCCTCAGA ATGGAAACGA ACAGCCTATG GGTTCAGAAG TACTAGAAGG TAAAACCTTG 1380 AGAAGTGATA GCACAGAAGA ACTGGGCAAT GCACTTTATG ATGATTCAAA GAAGACTCCA 1440 CACGTTCCTT CCTATCAGCA GATTAATTGT GTTGATAGTA TCATCAGATA TCTAGAGAGC 1500 TGCAGTGTTC CAGTATTGAA AAGGAAATCT AAATCTTCCA CAAATACATC ATCATCTTCA 1560 GATGGTGACA AGAAAAACCA GGAGATCGGG GCATTGGGAG TTAATTCCCA AACTCCAGTA 1620 TTTGCTGATC AGGAAGAGAT GCTGAAGAAG CAGACAAATG AAGGCATTGT GGGAGCTCCT 1680 CTGCCAGACC TGACCCTGTC CAACAAGTCT CTGAGTGTGG GATCTGCCTC CAGCCAGTGC 1740 AGTTACAGCA GCACTATTGT GCACGTCCCA CACCCTGAAT CAGTGCCCTG TTTTCCTTTG 1800 CGTTGTAACT TCACGACATA CTTCTCAAAT GCACCAAATC CTGTTACAGT GGCTGAGGAG 1860 TTAAAGCCAG TTGGGTTAAC AAAAGAGGCT TTGTCAGTCC ACACTCAAAA GGAAGAGCAA 1920 AACTACGTGG ACAGGTTCCG CAGGAGGATC TTGCTCTCTC CGTTTAGGAC TTGCCTTCAG 1980 TGGGATAGCA GAAGTAACAA TGGGCATTCC TATGACCAAG GAAATTCTCC TTCTAAGGAG 2040 ATGACTCCAA CCAGCTGTAA AAATGGCAAA AAAGGAAAAT TCAAGCACTG GAAACCTCAG 2100 AGACAGTCCT CAGATAGACG ATCTCGTAGT AAAAATAGAA ACAGTTTTCC ATGTGAGAAG 2160 AGAAGAATTC AGAAGCAGTC ACTTTCTCCC TCAGAAATGT CCTGTTTAAG GTCCTCCAGT 2220 ACGAATTGCT TTCCTCCTGT AGGATTTCCT GTCTATTCAG ATGCACTATC CAGTTTTCAA 2280 GCCTCTTCCA TAGGAGAGGA ACTTGCTATT TACTCAACAA AACCTGAGCC CACGTCATTG 2340 TCACAGCTGT GCTGTGGAGC ACCATCAATT CCAGCACTTT CTCCCCCAAA CATGGGGATG 2400 TTTATGGCTG CATTTTTTCA CAATTTCCCC ATATATGCTC AGATGCCTCA ATATGCCTTT 2460 CTTCCTAGCC CTCAGAATGT TTATCTCCCT TCTTCATATC CATGCACTAC TCTACCTCCT 2520 GCCCCTCCTC CTTCAGCTCC ATCAGCCATA GCCCCAGTCT CTGTGGGTCA GTCCTATCCG 2580 GCCTTTTCTG CCGCATCCAC GGAGGAGCAG CCGGAGGGAC AGCATGGCTG GGCCTTACAG 2640 CTGAGTAGCT CACGGAGCAG CTCCCCCCTT CAGCTGAATT TGCTTCAAGA AGAGCTGCCA 2700 GAATCTGCGG AGCCTTTGGT TAATGCTGAT GTTAAAGTAT ATGCAGAAGC TAAATGTGGC 2760 ACAAATAACA CAGGAGGCAG AGAAACTACG TTTGAGCCCA TGGGAACTTG TAGCAGTGCA 2820 GAGTTGGTGC TCAGTAAATC TCACAGTGCT TTGGCAATGC TTTCTTTATT TTTTTCCCCA 2880 TTAAATTGTG AGTCCCACAG TCTCTGTGGA GAGTTAAAAC AAAGGAAACC CCCTGGGGAC 2940 AATAGTCGGG AAGATAGTGG TAACAGTGCT AGTAGCCATT GTGCTTCATG TGAATGTACT 3000 GACCGCTTGC TGCGTGAGGA CTCCCAGTCA GGCGCAGGTT CAGCAGCATC AGCAGGCAGT 3060 AGGAAAAGCA GCAAGTATTT TGCCAGTAAT GATTCTTCTG AAACTTCCAA AACAGACACT 3120 AATCAAGAGG CAAAAGAAAA ACAGACATCT CATAAATCTA AACATGAGTC AGCCTGGGTG 3180 ACGATGGATC GCACACCTGA GCAAGTTCTA ATGACGTACC AAATGCCCAA CAGAATTAAA 3240 GAGGAAGTTT TAAAAGAGGA TATGGAGAAG CTGATAGTCA TGCGACAGCA ACAGCCTTGG 3300 TTTTCAGATA GGCAAAAGAG GGAGCTTGCA GAAGTGCATA CGTGGCTCCA GACACAGACT 3360 GTCCCACTAC AAATCAACAT TCAAGGATGT GTTACGTGTG ACATCAGGGA AGCAACTTGT 3420 GAGGCTGCAA TGGCTGATGA CAATATG 3447 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence Source | Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthology |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||