CGDB Gene Information
| Tag | Content | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CGDB ID | CGD-SuS-028663 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl Accession | ENSSSCP00000027064.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Name | PER3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl Information | ENSSSCG00000028572; ENSSSCT00000027190 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Sus scrofa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NCBI Taxa ID | 9823 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Circadian Information |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | period circadian clock 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:8847](View all) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Sequence (Fasta) |
QNPRGNQRPE LEGPQASGPE ALGKDSAEMW HQKHQLQGKY TETSHRQCEF RDRVFEELIT 60 VVQEMKTHFP SARHSKPSTL DALNYALRCV HSVQANSEFF QSLRQNNGAP QADVTVYRPE 120 ELATIASEHA SKNTDTFVAV FSFLSGRLVH ISEQAPSVLN CRKELLESSP FAELLAPQDV 180 GVFYSHTAHA QLPFWNNWTQ RASPHDLAPV KSFFCRIRSG GDAGKPERLY GPFRIVPYLI 240 HLHSPARPEP EPCCLLLLNH NGNSAPRIPE NKRVFTTTHT PGCVFLEIDE RAVPLLGYLP 300 QDLIGTSILT HLHPEDAALM LAVHQKVLKL AGQPPFDHSP IRFCSQNGDY IILDSSWSSF 360 VNPWSRKISL IIGQHQVRTS PLNEDVFATR IKKMNSNDKD ITELQEQIHK LLLQPVRGGS 420 PADGGCGSLG SSGSPEHPVS LASSSGSSGR CEEEPRAAST LQQVHASVDK VKTPGQQLYS 480 ESMTKSPKKQ VTGTRTAGPG GESGEQEAFS SFQTLKNDRM CTESCEDLET DQHSPSYQQI 540 NCIDSVIRFL KSHDMPALKR KCRSYTNTAS SSSGEDGPNP GAAASRIPAT PASGVPATGW 600 PIDAVGGAPG PVDTTALDLD VSQSSDCSTI VHILPPESGS VEVGTSPATP PQHQSAEDFK 660 HRGLTEAVPS AHMQKEEQSY VDKFREKVPS SPYSLCLQQE NGGKTKYAHG QGDPAPPPTR 720 SAGCKKGKPR RKKLLLLSDS KGAEDSICPP LRPEVQAGQP WCPASASLAA AVMVPSPAPY 780 MFPALSLPAV TSVGGEGAAS GPAPPGPPEP PVPRGSWSLP ALPSACLDPF MNLFLHDPPV 840 CALLSPSFAS DPFLGAPGTS ELPPSVSALA ADLDAASSFI SERPGEEKWG AQSEAHPLGL 900 SGASSPLQLS LLRGDRPRSG EASGPVRSDV CLEAERQCVG GPSGNKNSYF TASDLPTVSL 960 HKTSPPETGS AATGSSHSNI DFASSDSSSE ITPGGQQSQD EQRKETFPGL ADDSIWRMIE 1020 QTPECVLMTY QVPKRVKEIV LREDLEKLGS MRRRQPHFSH GQRKELAAVY AWIQSQTVPQ 1080 ERDTQRSCVP CGNKDSAGEA GAATESRGRD PAGDGN 1116 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide Sequence (Fasta) |
CAGAACCCCA GGGGGAACCA GCGACCCGAA CTTGAAGGAC CACAGGCCAG CGGTCCTGAG 60 GCCCTGGGGA AAGACTCTGC GGAGATGTGG CACCAGAAAC ACCAGCTGCA GGGCAAATAC 120 ACGGAGACCA GCCACAGACA GTGTGAGTTT CGAGACAGAG TGTTTGAAGA ACTTATCACG 180 GTGGTCCAAG AAATGAAAAC ACACTTCCCG TCGGCGAGAC ACAGCAAACC AAGCACTCTG 240 GACGCCCTCA ACTATGCCCT TCGCTGTGTG CACAGCGTTC AAGCAAACAG TGAGTTCTTC 300 CAGAGTCTCC GGCAGAACAA CGGAGCGCCT CAAGCAGATG TGACCGTGTA CCGTCCGGAG 360 GAGCTGGCCA CTATTGCTTC GGAGCACGCT TCCAAAAACA CAGATACCTT TGTGGCAGTT 420 TTTTCATTTC TGTCTGGGCG GTTAGTGCAC ATTTCCGAAC AAGCTCCCTC AGTCCTGAAC 480 TGCAGGAAGG AGCTCTTGGA GTCCTCGCCC TTCGCTGAAC TGCTTGCGCC TCAGGATGTG 540 GGCGTGTTCT ACTCGCACAC CGCCCACGCC CAGCTTCCTT TCTGGAACAA CTGGACCCAA 600 AGAGCCTCAC CGCATGACCT CGCGCCCGTG AAGTCCTTTT TCTGCAGGAT CCGCAGTGGA 660 GGCGACGCCG GGAAGCCCGA GCGGCTGTAC GGCCCATTCC GGATCGTCCC CTATCTGATC 720 CACCTGCACA GCCCTGCCCG CCCGGAGCCC GAGCCCTGCT GTCTCCTGCT GCTGAACCAC 780 AACGGGAACT CAGCTCCTCG AATCCCAGAG AATAAAAGGG TTTTTACCAC AACACACACC 840 CCAGGGTGCG TTTTTCTTGA AATAGATGAA AGAGCAGTGC CTCTGCTGGG TTACCTGCCC 900 CAGGATCTGA TCGGCACGTC CATCCTGACG CACCTGCACC CGGAAGATGC TGCTCTGATG 960 CTCGCCGTAC ACCAAAAGGT CTTGAAGCTT GCGGGCCAGC CTCCCTTTGA CCACTCACCC 1020 ATTAGATTCT GTTCTCAAAA TGGGGATTAC ATCATCCTGG ATTCCAGCTG GTCCAGCTTT 1080 GTGAACCCCT GGAGCCGGAA GATTTCTCTC ATCATCGGTC AGCATCAAGT TCGAACGAGT 1140 CCACTAAATG AGGATGTTTT TGCCACCAGA ATAAAAAAGA TGAACAGTAA TGACAAAGAC 1200 ATAACAGAAT TACAAGAACA AATTCACAAA CTTCTCTTAC AGCCAGTCCG CGGGGGGAGC 1260 CCGGCCGATG GCGGCTGCGG GAGCCTGGGA AGCAGCGGAT CACCTGAGCA TCCTGTGAGC 1320 CTCGCCTCTT CCAGCGGGTC CAGCGGGCGC TGCGAGGAGG AGCCCAGGGC AGCGTCGACT 1380 TTGCAGCAGG TCCACGCCAG TGTAGACAAA GTCAAGACTC CAGGTCAGCA GCTCTACAGC 1440 GAGTCAATGA CCAAATCCCC AAAGAAGCAG GTGACGGGGA CCCGCACAGC TGGGCCTGGT 1500 GGTGAGTCAG GTGAGCAGGA GGCCTTTTCT TCCTTCCAGA CCTTGAAAAA TGATCGCATG 1560 TGCACCGAGT CGTGTGAGGA TTTGGAAACG GATCAACACA GCCCATCCTA TCAGCAGATT 1620 AACTGTATTG ATAGTGTTAT CAGGTTCCTG AAGAGCCACG ACATGCCAGC TCTGAAGAGA 1680 AAGTGCAGGT CCTATACAAA CACAGCGTCC TCCTCCTCGG GAGAAGACGG ACCAAACCCC 1740 GGAGCAGCTG CTTCTCGGAT CCCAGCCACG CCTGCATCAG GAGTGCCAGC CACCGGGTGG 1800 CCCATAGACG CCGTGGGAGG GGCTCCAGGG CCCGTGGACA CCACGGCTCT GGACCTGGAC 1860 GTGAGCCAGA GCAGTGACTG CAGCACCATT GTCCACATCC TGCCACCAGA GTCAGGATCA 1920 GTGGAAGTGG GGACCAGCCC AGCCACACCA CCTCAGCACC AGTCGGCAGA AGACTTTAAA 1980 CACAGAGGCC TCACAGAGGC TGTCCCGTCG GCCCACATGC AGAAGGAAGA GCAGAGTTAC 2040 GTGGATAAAT TCCGGGAAAA GGTTCCGTCA TCACCCTACA GCCTCTGTCT TCAGCAGGAA 2100 AACGGAGGCA AAACGAAATA TGCACATGGG CAAGGAGATC CTGCTCCCCC TCCGACCCGA 2160 TCCGCTGGTT GCAAGAAGGG GAAGCCCAGG CGAAAGAAGC TGCTCTTGCT GTCGGACAGC 2220 AAGGGCGCTG AGGACAGCAT CTGTCCCCCG CTCCGCCCAG AGGTCCAGGC TGGACAGCCC 2280 TGGTGCCCTG CCTCTGCCTC ACTCGCAGCT GCAGTAATGG TTCCCAGCCC GGCCCCTTAC 2340 ATGTTTCCAG CTCTTTCCCT CCCAGCCGTG ACCTCCGTGG GGGGAGAAGG CGCAGCCTCG 2400 GGCCCTGCGC CGCCCGGCCC GCCTGAGCCG CCTGTCCCCC GTGGCTCGTG GTCCTTGCCT 2460 GCTCTCCCCT CTGCTTGCTT AGACCCTTTT ATGAACCTTT TCCTGCATGA CCCTCCCGTC 2520 TGTGCTCTCT TGTCACCATC CTTCGCCTCG GATCCGTTCT TGGGAGCACC AGGCACCTCT 2580 GAACTACCTC CCTCGGTCTC AGCACTGGCT GCAGACCTGG ATGCCGCCTC TTCCTTCATC 2640 AGCGAAAGGC CTGGTGAGGA GAAGTGGGGG GCACAGAGTG AAGCGCATCC CCTCGGTCTC 2700 TCAGGGGCCA GCTCCCCGCT ACAGCTCAGC CTCCTGCGGG GGGACAGGCC CAGATCCGGG 2760 GAAGCGTCAG GTCCCGTGAG AAGCGATGTT TGCCTGGAAG CCGAGCGTCA GTGTGTTGGT 2820 GGCCCCAGCG GGAATAAGAA CAGCTATTTT ACTGCCAGTG ACCTGCCCAC AGTATCACTC 2880 CACAAGACGT CGCCACCGGA AACTGGTTCT GCAGCCACAG GAAGCAGCCA CAGCAATATA 2940 GATTTTGCTA GTAGTGATTC TTCTTCTGAA ATCACCCCAG GTGGGCAGCA GTCTCAGGAT 3000 GAACAGAGGA AGGAAACATT TCCCGGCTTG GCCGACGACT CCATCTGGAG AATGATAGAA 3060 CAAACGCCTG AGTGTGTTCT GATGACCTAT CAGGTGCCCA AGAGGGTGAA AGAAATCGTA 3120 CTGAGAGAAG ACCTAGAAAA ACTAGGAAGC ATGAGGCGGC GGCAGCCACA CTTTTCTCAC 3180 GGACAGAGGA AGGAGCTGGC CGCCGTGTAT GCGTGGATTC AGAGCCAGAC TGTCCCTCAA 3240 GAAAGGGACA CCCAGCGAAG CTGTGTCCCT TGTGGAAACA AAGATTCAGC CGGGGAAGCC 3300 GGTGCTGCTA CAGAGTCCCG TGGTCGGGAC CCAGCAGGAG ATGGCAACTG A 3351 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence Source | Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthology |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||